Досегашната ГД в Европейската комисия вече се нарича Генерална дирекция „Морско дело и рибарство“. Създават се три дирекции на регионален принцип, които обхващат съответно:
• Арктика, Атлантическия океан;
• Средиземно и Черно море
• Северно и Балтийско море, страни без излаз на море.
Тези Дирекции ще бъдат допълнени от хоризонтална дирекция, която ще осигурява координация и развитие на политиките. Международната дирекция ще запази отговорностите си по отношение на външнополитическото измерение на въпросите на морското дело и рибарството. Последната, шеста Дирекция, ще отговаря за правни въпроси, ресурси, комуникация и взаимоотношения с други институции и заинтересувани страни.
Реорганизацията се прави с цел да подобри капацитета на Европейската комисия да развива и изпълнява общностните политики по отношение на морското дело и рибарството.